Fida International on yleishyödyllinen yhdistys. Toiminnan rahoituksen merkittävimmät lähteet ovat yksityishenkilöiden ja yhteisöjen lahjoitukset, jäsenseurakuntien tukimaksut, Fida lähetystorien tuotot sekä Suomen valtion ja Euroopan unionin kansalaisjärjestöjen kautta suunnatut kehitysyhteistyön määrärahat.
Fida lähetystorien tuotoilla katetaan Fidan kehitysyhteistyön omarahoitusosuutta, joka on vähintään 15 prosenttia kehitysyhteistyöohjelman kuluista. Loput varoista myöntää Suomen ulkoasiainministeriö Fidan ja ministeriön kehitysyhteistyön kumppanuussopimuksen pohjalta.
Ulkoasiainministeriö valvoo kymmenen kumppanuusjärjestönsä kehitysyhteistyövarojen käyttöä. Fida käyttää vain ammattimaisia tilintarkastajia.
Fidan oman katastrofirahaston varat pystytään ohjaamaan nopeasti kenttätoimenpiteisiin. Järjestöllä on myös rahoitushaun mahdollistava kehyssopimus Euroopan komission humanitaarisen avun pääosasto ECHO:n kanssa.
Fidan lähetystyöntekijät ovat pääosin helluntaiseurakuntien palkkaamia. Fidan jäsenseurakunnat maksavat jäsenmääränsä mukaista tuki- ja koulukassamaksua, jolla tuotetaan palveluja seurakunnille ja lähetystyöntekijöille ja kustannetaan lähetystyöntekijöiden lasten koulunkäyntikuluja.
Varoja saadaan myös testamenttilahjoituksina ja tukiryhmien, kuten Fidan bisnestiimin kautta.
Vapaaehtoisten panos on tärkeä Fidan työlle. Ulkomailla tapahtuvaan lyhytaikaiseen vapaaehtoistyöhön osallistuu satoja ja harjoitteluun kymmeniä henkilöitä vuosittain. Fida lähetystoreilla työskentelee pääosin palkatun henkilökunnan lisäksi huomattava joukko vapaahtoisia. Muussakin toiminnassa vapaaehtoistyön merkitys on suuri.
Järjestön toiminnalle antavat hyvät edellytykset sen pitkä kokemushistoria, luotettavat ruohonjuuritason kumppanit eri maissa, osaavat työhönsä ja kristillisiin arvoihin sitoutuneet työntekijät sekä 1970-luvulta asti jatkunut yhteistyö Suomen valtionhallinnon kanssa. Näiden ansiosta Fidan kautta annettu apu menee nopeasti ja luotettavasti perille.